O Campus Guarujá, instalado em uma área de 30 mil metros quadrados, possui ampla infraestrutura para o ensino, pesquisa e extensão, e instalações acessíveis à comunidade. Disponibiliza laboratórios equipados e estrutura necessária para o desenvolvimento de habilidades e competências nas várias áreas profissionais. Espaços e recursos para capacitação dos alunos e atendimento à população.
Laboratórios Específicos
O conjunto de laboratórios e espaços de aprendizagem nas áreas de Humanas, Exatas e Saúde tem o objetivo de capacitar os alunos a desenvolverem competências em Metodologias e Tecnologias que contribuam para o seu aprendizado. Nestes laboratórios, os alunos podem realizar atividades práticas do curso, além de servir de suporte às atividades complementares e de pesquisa inerentes às suas especificidades.
Laboratórios de Informática
Os laboratórios de Informática do campus Guarujá são utilizados, além das aulas, para as atividades de pesquisas e de projetos sociais. Possui seis salas, localizadas no Piso B, todas equipadas com modernos computadores e acesso à internet.
Clínica-Escola de Enfermagem Elmara Bonini
Na Clínica-Escola de Enfermagem da Unaerp Guarujá, localizada no subsolo, os alunos realizam atendimento à comunidade interna e externa em trabalhos de prevenção, promoção e manutenção da saúde com procedimentos técnicos como curativos, coleta de material citológico para diversos exames, entre outros serviços.
Clínica-Escola de Fisioterapia Evandro Bonini
A Clínica-escola de Fisioterapia da Unaerp Guarujá é equipada com recursos adequados para avaliações e técnicas terapêuticas nas áreas de ortopedia, traumatologia, reumatologia, neurologia adulto e dermatofuncional.
Escritório de Assistência Jurídica
Vinculado ao Curso de Direito, permite à comunidade assistência jurídica gratuita na área áreas Cível, Direito de Família, Direito do Consumidor, com a possibilidade de ingresso e acompanhamento de processos judiciais. O atendimento proporciona aos estudantes o contato com as demandas jurídicas da população.
Centro Judiciário de Solução de Conflitos e Cidadania (CEJUSC)
Em parceria com o Tribunal de Justiça de São Paulo, o departamento instalado na Unaerp
Guarujá beneficia a população com acesso rápido à justiça pelas audiências de conciliação., em casos de Direito Civil, Juizado Especial Civil, Família e na área de Pré-processual, quando ainda não há o processo instalado.
Centro Tecnológico de Estudos das Engenharias
No local são realizadas atividades práticas dos núcleos profissionalizantes e específicos dos cursos de Engenharia e estudos científicos de tecnologias e materiais, e ainda, recebe eventos e cursos realizados em parceria com entidades do segmento.